Nowe Muzeum Akropolu składa się z trzech głównych kondygnacji: dolnej, środkowej i górnej. Zewnętrzna część budynku stanowi elewację z izolacyjnego szkła VARIO z funkcją kontroli przenikania światła słonecznego. Kolejna warstwa wewnętrzna - oddalona o 70 cm od fasady za pomocą szklanych żeber i unosząca się na wysokości 2,25 m od wykończonej posadzki - została wykonana z laminowanego szkła bezpiecznego STADIP. Funkcja kontroli słonecznej szyb izolacyjnych zapewnia, że nawet jeśli temperatura na zewnątrz przekracza 40°C, temperatura fasady od wewnątrz będzie wynosić tylko ok. 23°C.
Dolna kondygnacja muzeum wznosi się ponad istniejącymi wykopaliskami archeologicznymi na specjalnych palach. Rozwiązanie to pozwala chronić ruiny dzięki starannie rozmieszczonej - w porozumieniu z ekspertami - siatce kolumn. Na tym poziomie znajduje się również lobby, tymczasowa przestrzeń wystawowa, audytorium oraz wszelkie konstrukcje wsporcze.
Szklana rampa, przez którą można podziwiać wykopaliska, prowadzi do galerii na drugim poziomie budynku stanowiącej spektakularne pomieszczenie o wysokości podwójnej kondygnacji wsparte na wysokich kolumnach. W szklanych podłogach w całym muzeum, a w szczególności na dolnych poziomach mieszczących wykopaliska, zostało zastosowane szkło LITE-FLOOR.
Najwyższa część muzeum stanowi przestrzeń otoczoną przezroczystą konstrukcją, zapewniającą doskonałe światło dla rzeźb oraz wspaniały widok na Akropol. Elewacja została wykonana z czarnego szkła emaliowanego EMALIT oraz z wykorzystaniem najnowocześniejszych technologii szklarskich w celu ochrony galerii przed nadmiernym oddziaływaniem światła i ciepła.
